ГПУ «НП «Беловежская» пуща» занимает восточный выступ бассейна р. Висла, который образован притоками Буга – Наревом и Правой Лесной. Вблизи северной границы парка берут начало реки Свислочь и Россь (притоки Немана), а у северо-восточной находятся истоки Ясельды (приток Припяти). Здесь проходит водораздел между бассейнами Балтийского и Черного моря.

Территорию собственно национального парка дренируют водосборы Нарева и Лесной (Левой и Правой), принадлежащих к бассейну Вислы.

Нарев, берущий начало в болотах урочища Дикое, играет исключительно важную роль в регулировании гидрологического режима в северной части национального парка. Основным его притоком является р. Наревка. Главные водные артерии в южной части парка – это реки Правая Лесная и Левая Лесная.

  На схеме представлена гидрографическая сеть территории национального парка, а в таблице – характеристика основных его рек и водоемов.

Название

Протяженность/площадь
(км/га)

Высота истока над у.м.
(м.) 

Средний уклон русла
(%)

Скорость течения
(м/с)

Водосбор
(км.кв.)

р. Белая

13

157

0,6

0,2

366

р. Вишня

17

158

0,8

0,1-0,2

121

р. Гвозна

9

159

0,6

0,1

-

р. Горбач

9

167

1,1

0,3

-

р. Дрюновка

13

169

0,9

0,1-0,2

-

р. Колонна

14

179

1,0

0,2-0,3

278

р. Лесная Левая

38

162

0,4

0,2

-

р. Лесная Правая

29

-

0,5

0,3

-

р. Ломовка

10

186

2,6

0,1-0,2

-

р. Медянка 

17

189

1,2

0,1

91

р. Нарев

33

159

0,6

0,2-0,3

 

р. Наревка

8

155

0,4

0,2-0,3

253

р. Немержанка

9

160

0,9

0,3-0,4

32

р. Переволока

13

155

0,5

0,2-0,3

127

р. Плюсковка

6

162

1,0

0,1

-

р. Полична 

8

159

1,1

0,2

-

р. Пчелка

13

169

1,4

0,1-0,2

55

р. Россь

4

174

1,4

0,1-0,2

 

р. Рудавка

14

156

0,8

0,2-0,3

173

р. Сипурка

11

170

1,5

0,3

-

р. Точница

6

158

0,4

0,1

-

р. Тушемлянка

12

162

1,0

0,1

40

р. Хоровка

6

176

2,2

0,2-0,3

 

вдхр. Ляцкое

260,4

-

-

-

-

вдхр. Хмелевское

81,4

-

-

-

-

вдхр. Сипурка

26,6

-

-

-

-

вдхр. Переровница 

20,1

-

-

-

-

вдхр. Колонна

16,9

-

-

-

-

 Кроме перечисленных в таблице, по территории национального парка протекают более мелкие ручьи и речки, протяженностью до 5 км (Ольховка, Вьюновка, Кулевка, Переровница, Калиновец, Муравка, Тисовка, Побойка, Песять и др.).

Естественных озер нет. Но в результате гидромелиоративных работ создано несколько достаточно крупных искусственных водохранилищ (Лядские, Хмелевское, Сипурка, Переровница, Колонна) и ряд более мелких (12 водоемов площадью от 1 до 10 га и 49 водоемов площадью до 1 га).

Достаточно обширна сеть мелиоративных каналов. Это особенно касается земель, переданных в состав национального парка в последнее десятилетие, где в 50-60-е годы прошлого столетия на землях колхозов, граничащих с Беловежской пущей, проводились мелиоративные работы осушительного характера. Были спрямлены и углублены русла некоторых рек (Наревка, Белая), что вызвало понижение их уровня, созданы новые искусственные водотоки, осушены урочища Докудово (130 га), Зубрица (160 га), Галево Болото (300 га), Теплухи (300 га), ур. Никор (1450 га). Всего площадь осушенных земель на территории пущи составляет 2340 га, а общая длина гидромелиоративной сети, по данным лесоустройства 2006 года, – 592 км.

Режим водоемов национального парка характеризуется интенсивным весенним половодьем и устойчивой летне-осенней и зимней меженью. Подъем уровня воды во время весеннего половодья обычно начинается в середине марта (в ранние весны – во второй половине февраля, в поздние – в первой декаде апреля) и продолжается 7-15 дней. Максимальный весенний подъем воды составляет около 2,0—2,5 м (в отдельные годы 3,0 м). Средняя продолжительность половодья – около 60-70 дней.

Летняя межень наступает в первой половине мая. Почти ежегодно (1-2 раза в сезон) она прерывается дождевыми паводками. Многолетняя амплитуда зимних меженных уровней составляет 20-40 см.

Устойчивый ледовый покров образуется в третьей декаде декабря (с отклонениями от этого срока к первым числам декабря или к третьей декаде января). Обычная толщина льда составляет 35-45 см. Водоемы вскрываются в середине марта – первой декаде апреля. Дождевые паводки наблюдаются ежегодно, а в дождливые годы до 3-4 раз.

Речной сток зависит, главным образом, от количества выпадающих осадков и испарения. Большая его часть приходится на весенний период.